Nach den einschneidenden Ereignissen der ersten Staffel sieht sich Tomoharu in einer schwierigen Lage. Er weiß, er muss seine Asura Machina Kurogane im Kampf einsetzen, um den Treiben des Schurken Takaya Kagakagari ein Ende zu bereiten, aber er will dabei keinesfalls das Wohlergehen seiner besten Freundin Misao Minakami aufs Spiel setzen, denn immer wenn er Kurogane einsetzt, verringert sich ihre Lebensdauer. Auch seine Beziehung zu Kanade Takatsuki wird immer tiefer und so langsam entwickelt sich daraus eine handfeste Liebesbeziehung. Doch was soll Tomoharu nur machen, um Misao endlich aus den Fängen der Asura Machina zu befreien. Verzweifelt ist er auf der Suche nach Lösungen, um ihr das Schicksal des Verschwindens zu ersparen.