Darker than Black: Kuro no Keiyakusha Gaiden beantwortet die Frage, was zwischen Staffel 1 und Staffel 2 passiert ist.Hei und Yin konnten zusammen aus Tokio fliehen. Die beiden leben ein normales Leben auf einer kleinen Insel. Doch Agenten des Syndikats versuchen Yin zu entführen. Hei kann es zunächst verhindern, doch die Flucht beginnt erneut …