»NekoparA« knüpft an die Handlung von »Nekopara« an. Ein neuer Tag beginnt im Leben von Kashou Minazuki, dessen Pâtisserie La Soleil mittlerweile sehr gut läuft. Während er für die beiden Katzenmädchen das Frühstück zubereitet, versucht Vanilla die schläfrige Chocola aus dem Bett zu bekommen. Am Essenstisch denkt Kashou an die Anfänge von La Soleil zurück und wie er Chocola und Vanilla im Umzugskarton entdeckt hat.

Zur selben Zeit machen sich auch Maple und Cinnamon auf der Weg zur Arbeit im La Soleil. Da sie allerdings zu spät kommen, ist Chocola bis zu ihrem Eintreffen bereits halb verhungert und hätte sich am liebsten von den Kunden mit Kuchen füttern lassen. Während ihrer Schicht beobachtet Cinnamon die zufriedenen Kunden und verfällt in romantische Tagträume, in denen sie von ihrer Schwester Maple mit Kuchen gefüttert wird. Nach Ladenschluss machen sich Maple und Cinnamon wieder auf den Weg nach Hause.

Zum Abendessen soll es Thunfisch geben, den die beiden von Shigure mitgebracht haben. Da Kashou jedoch nur Sojasoße zu Hause hat und kein Ponzu, macht sich Chocola auf den Weg in die Stadt, um die Würzsoße zu kaufen. Dabei trifft sie in einem Park auf ein kleines, verlassenes Katzenmädchen. Chocola schenkt ihr spontan etwas Schokolade und setzt ihren Weg fort. Wieder Zuhause angekommen bemerkt sie jedoch, dass ihr das fremde Katzenmädchen gefolgt ist.