Die Geschichte spielt in einer Zeit als die Welt sich in tiefster Verzweiflung befand, nachdem ein Gift namens »Shinobi« durch einen Asteroiden auf die Erde kam. Die Menschen fliehen an einen Ort namens »Kairiku«, welcher sich am Grund des Meeres befindet. Dort versuchen die Menschen sich gegen die Auswirkungen des Giftes zu schützen. In einer solchen Welt gab es nur ein einzigen Hoffnungsschimmer: Die heilige Waffe »Giga-Road« und der legedäre Krieger »Yagyuu« werden benötigt, um sich gegen die Auswirkungen des Giftes zu stellen. Um die Welt zu retten, reist Ame, die Prinzessin einer gefallenen Nation, durch die Welt um das Unheil zu vertreiben.