Die zweite Staffel von xxxHolic setzt dort an, wo die erste Staffel aufgehört hat und führt Watanukis Erlebnisse, die meistens irgendetwas mit Japans Geisterwelt zu tun haben, fort. Einmal mehr muss er sich dabei mit der exzentrischen Yuuko herumschlagen, die trotz aller Schwierigkeiten, die sie ihm bereitet, auch einige wichtige Lektionen über das Leben bereithält.