Durch einen Krieg wurde der Planet Zi nahezu zerstört. Einige Bewohner konnten sich jedoch retten und besiedelten nach der Schlacht den Planeten neu. Ruuji Famailon, der Sohn des hiesigen Dorfanführers, findet eines Tages mit seinem Vater und einigen anderen Männern ein im Wasser verschollenes Zoid. Dieser hat die Form eines Tigers und ist gegenüber den Arbeitszoids viel größer. Als daraufhin das Dorf von der bösen Macht namens Digald angegriffen wird, schafft es nur Ruuji den Zoid zu erwecken und zu lenken. Durch diesen Kampf geht jedoch der Generator der Dorfes, welcher die Lebensgrundlagen wie fruchtbare Böden und fischreiche Meere sichert, kaputt. So macht sich der kleine Ruuji auf den Weg einen Mechaniker zu suchen, um sein Dorf zu retten.