Takato und Guilmon gehen auf eine Reise nach Okinawa, wo sie einen Tamer namens Minami treffen. Kaum zurück in ihrer Heimat Japan verwandelt sich plötzlich ein populäreres Cyber Haustier in einen Computervirus, der alle Computer befällt, die mit ihm in Kontakt kommen. Als das Virus beginnt sich auszubreiten, versucht Takato herauszubekommen, warum die Digimon plötzlich seinen neuen Freund Minami angreifen und in welchem Zusammenhang das mit dem neuen Virus steht.