Wochen nachdem Gintoki, Kagura und Shinpachi sich gegen die Bakufu auflehnten, müssen sie sich nun zusammen mit Katsura und den Joui Rebellen im Untergrund verstecken. Währenddessen ersucht Imai Nobume die Yorozuya wegen eines Auftrags. Bei dem Gespräch mit ihr erfahren Katsura und Gintoki auch mehr über ihren ehemaligen Lehrer. Anschließend tauchen zwei Mitglieder der Kiheitai auf. Dies wurde von Nobume eingefädelt, damit sich die Yorozuya, die Kihetai sowie die Kaientai von Sakamoto zusammentun und Takasugi sowie Kamui vor Utsuro und seinen Harusame retten.