Zwei Jahre sind nach dem Ende der ersten Staffel vergangen. Durch den Tod des magischen Kirschblütenbaumes scheint die Magie von der Insel Hatsunejima fast gänzlich verschwunden zu sein und so verbringen unsere Helden aus der ersten Staffel jetzt ein relativ normales Leben. Doch eines Tages tritt ein junges Mädchen namens Aisia in Jun’ichis Leben, die von ihm unbedingt zur Magierin ausgebildet werden will. Welche Verbindung hat sie zu Sakura und wo ist eigentlich Nemu?