Ulysses: Jeanne d'Arc to Renkin no Kishi spielt im 15. Jahrhundert, während des 100-jährigen Kriegs zwischen Frankreich und England, die sich im Kampf um die Thronfolge befinden. Während dieser gefährlichen Zeit besucht der junge Sohn eines Adligen, Montmorency, eine königliche Ritterschule, an der er sich mit den Handwerken Magie sowie Alchemie auseinandersetzt. Nur kurz nach der vernichtenden Niederlage Frankreichs in Agincourt wird die Schule jedoch geschlossen. Völlig wehrlos und ohne ein Zuhause streift der junge Alchemist durch die Welt und trifft eines Tages ein mysteriöses Dorfmädchen mit dem Namen Jeanne d'Arc. Doch welche Abenteuer erwarten die beiden …?